Ambientato nei Forgotten Realms, la storia di Baldur's Gate III vede il protagonista alle prese con un antico male, che lo colpisce da vicino in quanto si trova infettato dalla larva di un mind flayer. Da quel momento, si ritrova a dover decidere, attraverso una lunga serie di scelte che influiscono sull'andamento della storia del gioco, se distruggere l'origine del male oppure farsi sopraffare da questo e cercare il dominio assoluto sui Forgotten Realms.
